一、了解申报程序、充分准备备案及留存备查资料

根据国税发〔2008〕116号文第十三条规定：主管税务机关对企业申报的研究开发项目有异议的，可要求企业提供政府科技部门的鉴定意见书。根据该规定，企业申报研发费用加计扣除，需提请科委鉴定，科委通过之后企业报送资料至主管税局机关提交审核，审核通过，准予扣除。也即科委鉴定是前置性和必经程序。

根据国税发〔2015〕119号文第五条第三项规定：税务机关对企业享受加计扣除优惠的研发项目有异议的，可以转请地市级（含）以上科技行政主管部门出具鉴定意见，科技部门应及时回复意见……。根据该规定，科委鉴定不再作为前置性环节，由企业直接将申报资料提交税务机关，税务机关有异议可转请地市科技部门出具鉴定意见。

建议：

根据新规，加计扣除申报无需再通过科委鉴定，减少了审核程序，对企业来讲是一大利好，但同时也导致许多企业面临不确定项目是否可以进行加计扣除的困惑。因此，华税建议，（1）企业应当规范研发项目的管理，通过设置完善的立项、预算、审批、决算等对研发项目进行全程管理。（2）准备完善的备案及留存备查资料。研发费用加计扣除实行备案管理，根据《国家税务总局关于发布〈企业所得税优惠政策事项办理办法〉的公告》（国家税务总局公告2015年第76号）的规定，现将企业需准备资料整理如下：

序号
资料名称
序号
资料名称
1、企业资质证明
营业执照副本复印件等
3、研发机构及研发人员
研究开发专门机构或项目组的编制情况
研究开发人员名单
2、研发项目证明材料
研发项目计划书
研发费预算
研发项目立项的决议文件
研发项目的效应情况说明
研究成果报告
（标红部分新规取消、具体要求以科委所发通知为准）
4、研发费用归集表
 
2016年度研究开发费用发生情况归集表
6、辅助账
研发费用分配说明（包括人员、用于研发的机器设备等）
研发支出辅助账
 
二、合理归集人员人工费用、编制研发人员工时分配表       
  
国税〔2008〕116号
    在职直接从事研发活动人员的工资、薪金、奖金、津贴、补贴

财税〔2013〕70号
    企业依照国务院有关主管部门或者省级人民政府规定的范围和标准为在职直接从事研发活动人员缴纳的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金。　
国税〔2015〕119号
直接从事研发活动人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘研发人员的劳务费用。
  
新规对于人员人工费用取消了“在职”的要求，对外聘研发人员的劳务费用也可以进行加计扣除，符合企业对研发灵活性的要求。同时，根据国家税务总局《关于企业研究开发费用税前加计扣除政策有关问题的公告》（国家税务总局公告2015年第97号，以下简称国税发97号文）第六条第（三）款第4项的规定：企业应当……，并将下列资料留存备查：4从事研发活动的人员和用于研发活动的仪器、设备、无形资产的费用分配说明（包括工作使用情况记录）。费用分配说明能够更精准的说明企业研发费用中人员人工费用的产生过程，在适应企业研发多样性的基础上便于税务机关的后续管理。

建议：

1.完善对研发人员的管理。企业可根据规模成立专门的研发部门，或确定研发项目组成员，留存相关的审批设立文件备查。
2.编制研发人员工时分配表。（1）若科技人员同期参与多个项目的研发，应当根据参与各个项目的工时编制工时分配表，将该研发人员的工资、薪金等按照实际参与项目的工时合理分配，并留存工时分配表备查。（2）若科技人员并非专门从事研发的人员，同时承担生产或其他岗位工作，或某项目研发周期较短，应当编制工时分配表，根据该科技人员每月实际从事研发的时间按月汇总，从而合理归集该部分人员人工费用。

 
三、严格区分生产用和研发用、编制研发领料单、审批单等辅助核算

国税〔2008〕116号
 
（四）专门用于研发活动的仪器、设备的折旧费或租赁费。
（五）专门用于研发活动的软件、专利权、非专利技术等无形资产的摊销费用。
（六）专门用于中间试验和产品试制的模具、工艺装备开发及制造费。
国税发〔2015〕119号文
用于研发活动的仪器、设备的折旧费。  用于研发活动的软件、专利权、……的摊销费用。
   
国税发〔2015〕119号文扩大了直接投入、折旧费用、无形资产摊销费用的范围，取消“专门”的限制。但同时规定：企业应对研发费用和生产经营费用分别核算，准确、合理归集各项费用支出，对划分不清的，不得实行加计扣除。实践中，税务机关在企业可加计扣除费用进行核查时，若企业在“直接投入、折旧”等方面的费用过高，特别是占据总的材料成本及总的折旧金额比例过高时，会要求企业出具说明。

建议：

企业应当在日常的经营管理中严格区分生产用和研发用，编制领料单和审批单进行辅助核算。研发费用分配比例随意是企业中比较常见的问题，例如折旧费用与长期待摊费用、无形资产摊销费用、直接投入、人员人工等均会涉及此类问题。若企业单纯的核定某一百分比作为分配比例而没有相应的依据作为支撑，很难通过检查，而审批单的设置能较好的说明分配比例的设定，为研发费用再分配提供较强的数据支撑。
 
四、建立研发费用辅助账

国税〔2008〕116号文
企业必须对研究开发费用实行专账管理，同时必须按照本办法附表的规定项目，准确归集填写年度可加计扣除的各项研究开发费用实际发生金额。
国税〔2015〕119
号文
对享受加计扣除的研发费用按研发项目设置辅助账，准确归集核算当年可加计扣除的各项研发费用实际发生额。

新规从要求企业“必须对研究开发费用实行专账管理”改为“对享受加计扣除的研发费用按研发项目设置辅助账”，减轻了企业的会计核算负担，但是对于没有建立研发费用辅助账的企业而言，是一大挑战。

建议：

建立研发费用辅助账。国税发〔2015〕119号文附件包含了辅助账的样表，给企业以参考，企业应当建立研发费用辅助账留存备查。具体流程包括：设立符合企业自身研发需求的科目与完备的凭证体系→收集原始资料（包括研发费用明细账、与研发活动有关的有效凭证等）→分项目、分年度建立研发费用辅助账→将有效凭证和辅助账进行比对核查。
 
总结：

新政策虽然减少了审核程序，扩大了费用范围，但同时规定税务部门应加强该项优惠政策的优惠管理，并规定年度核查面不得低于20%，因此，企业应当从完善研发项目管理、合理准确归集研发费用、设置研发费用辅助账等方面增加风险防范意识，提高危机化解能力。